VMD是可视化常用的工具。
对盒子的操作：
1.打开vmd的安装目录；
2.找到vmd.rc文件，在文件中添加一行“source vmd_draw_unitcell.tcl”；（C盘的话有可能不能写入，最好复制到桌面，修改完直接粘贴到文件路径下覆盖即可）
3.设置盒子参数，如边长为60,60,60 则在命令窗口输入“molinfo top set { a b c} {60 60 60}”
4.显示盒子：输入“pbc box -on”
5.若盒子的中心在远点，则输入“pbc box -on -center origin”